Tương tác của con người với vi sinh vật (
tiếng Anh: Human interactions with microbes) gồm cả ứng dụng
vi sinh vật trên trong thực tiễn lẫn ý nghĩa biểu tượng, bên cạnh những tương tác tiêu cực dưới dạng bệnh ở người, động vật và cây trồng.Ứng dụng vi sinh vật trong thực tiễn bắt đầu ở thời cổ đại với quy trình
lên men trong chế biến thực phẩm;
bánh mì,
bia và
rượu được chế biến từ
nấm men từ bình minh của văn hóa nhân loại, chẳng hạn như ở
Ai Cập cổ đại. Gần đây hơn, vi sinh vật được ứng dụng trong những hoạt động
chiến tranh sinh học để sản xuất ra hóa chất nhờ
lên men, khi các nhà hóa học công nghiệp phát hiện ra cách để sản xuất hàng loạt hóa chất hữu cơ, gồm
enzym và phân tử sinh học hoạt tính như
hormone và chất
ức chế cạnh tranh dùng để làm thuốc. Lên men cũng được ứng dụng để sản xuất các chất thay thế nguyên liệu hóa thạch dưới dạng như
ethanol và
methan; ngoài ra
tảo cũng có thể dùng để sản xuất nhiên liệu. Vi sinh vật kỵ khí có vai trò quan trọng trong khâu
xử lý nước thải. Trong nghiên cứu khoa học, nấm men và vi khuẩn
Escherichia coli có chức năng làm
sinh vật mô hình, đặc biệt ở môn
di truyền và các ngành liên quan.Về mặt ý nghĩa biểu tượng, bài thơ đầu tiên về chế biến rượu là "
Hymn to Ninkasi" của người
Sumer từ năm 1800 TCN. Ở thời
Trung Cổ,
Mười ngày của
Giovanni Boccaccio và
Truyện cổ Caunterbury của
Geoffrey Chaucer: nhắc đến nỗi sợ bệnh dịch gây chết người, từ đó gây ra suy đồi đạo đức. Những tiểu thuyết gia khai thác
đề tài tận thế do
đại dịch gây ra gồm
Mary Shelley với cuốn
The Last Man (1826) và
Jack London với cuốn
The Scarlet Plague (1912).
Hilaire Belloc là tác giả bài thơ hài hước "The Microbe" vào năm 1912. Những bệnh dịch và lây nhiễm kịch tính đã hình thành mạch truyện của nhiều tác phẩm điện ảnh
Hollywood, bắt đầu bằng
Nosferatu vào năm 1922. Năm 1971,
The Andromeda Strain kể về sự việc một
vi sinh vật ngoài Trái Đất đe dọa sự sống trên hành tinh xanh. Những
nhà vi sinh vật học sau
Alexander Fleming đã sử dụng tập đoàn vi khuẩn nhuộm màu hoặc
huỳnh quang để chế tác những tác phẩm tiểu họa.Vi sinh vật như
vi khuẩn và
virus có vai trò quan trọng như
mầm bệnh, chúng là tác nhân gây bệnh ở người,
cây trồng và
gia súc.